PacBioシーケンシングシステム
長年にわたる最先端の研究開発に基づき、当社のシステムは、研究者の皆様による世界を変えるような新発見のお手伝いを可能にします。 当社のロングリードおよびショートリードシーケンスシステムの比類ない精度をご覧ください。
REVIOシステム ロングリードシーケンス
業界最高精度のHiFiシーケンスにより、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームの包括的視点を提供
年間最大1,300のヒトHiFiゲノムを処理するスループット
消耗品は取り扱いが簡単でプラスチック廃棄物を削減
Google Health DeepConsensusを搭載した強力な計算機能
Sequel IIeシステムロングリードシーケンス
すべてのランにおいて、装置から直接DNAメチル化検出を伴う長く正確なHiFiリードを取得
ターゲットシーケンス、RNAシーケンス、全ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションをサポート
微生物ゲノムシーケンス、AAVベクターシーケンス、Iso-Seqなどのスループットに適合
何百もの査読付き出版物で紹介された実証済みの技術
“Using PacBio sequencing we can detect mutations that otherwise would be missed in Illumina sequencing”
– van Schendel, NAR Genomics and Bioinformatics, 2022
アプリケーション
ターゲットまたは全ゲノムシーケンス、複雑な集団の研究、アイソフォームやエピジェネティック修飾の発見など、PacBioシーケンスはお客様の研究を向上させ、競争優位をもたらします。
全ゲノムシーケンス
全ゲノムシーケンス（WGS）は、ヒト、植物、動物、微生物を問わず、生物のDNA全体を評価します。HiFiシーケンスは、反復配列領域や高GCの多い領域においても、最大25kbの1分子リードから偏りのない99.9%のリード精度（Q30）で完全かつ正確な分解能で全ゲノムシーケンス情報を取得します。
ターゲットシーケンス
ターゲットシーケンスでは、ゲノム中の最も到達しにくい領域であっても、様々なバリアントタイプを正確に検出し、その理解を深めることができます。当社のターゲットシーケンスアプリケーションは、HLAシーケンスを含む、ヒトの生物医学研究、植物および動物科学、微生物学および感染症におけるアプリケーションに適しています。
RNA シーケンス
長くて正確なHiFiリードを用いたIso-Seq法による全長転写産物シーケンスでは、転写開始点と終了点の確認、スプライシングイベントの解析、アレル特異的アイソフォームの特定、アイソフォームレベルの分解能での発現プロファイル、融合遺伝子の検出、オープンリーディングフレームの全長予測など他のシーケンサーでは見過ごされる可能性のある新しい生物学的特性を見出すことが可能となります。
エピジェネティクス
HiFi シーケンスのユニークなケミストリーは、サンプルのエピジェネティック変化を直接的に捉えることを可能にします。メチル化検出を含む“5塩基HiFiシーケンス”により、研究者は同じシーケンスライブラリから遺伝子活性やその他の生物学的機能に関連するゲノム全体のメチル化パターンを特定することができます。
メタゲノムシーケンス
微生物群集がどのように機能し、また、環境と相互作用しているかについての新たな知見を得るためには、より優れたアプローチを必要とします。長くて正確なHiFiリードは、種レベルの分解能をもつ完全長16Sシーケンス、個々の遺伝子の機能解析を含むメタゲノムプロファイリングやそのアセンブリを可能とします。
シーケンス技術
HiFiリードとは何か?
HiFi リードは、PacBio ロングリードシステムのcircular consensus sequencing (CCS) mode を用いて作成されます。HiFiリードは、1分子リード精度 99.9%の塩基レベルの解像度を提供します。
HiFiリードは、de novoアセンブリのための全ゲノムシーケンス、包括的なバリアント検出、エピジェネティックな特性評価、RNAシーケンスなど、幅広いSMRTシーケンスアプリケーションで使用することができます。
Long-read sequencing
HiFi Sequencing
HiFi シーケンスは、高精度かつ完全なシーケンス技術として認知されています。
- PacBio HiFiはPrecisionFDAベンチマークにおけるトータルエラー（SNV + indel + SV）で異なるロングリードシーケンス技術だけでなく、既存のSBS技術に比べても大きくエラーを削減可能
- 最大25kbのリード長により、大きな構造変異や困難な反復領域をカバーし、全長転写産物をシーケンス可能
- 99.99%の精度を誇る高精度なシーケンス結果
均一なカバレッジにより、他のテクノロジーではアクセスできない領域のシーケンスが可能 - シーケンス中にメチル化など塩基修飾を直接検出することで、エピジェネティクス研究を加速
5塩基HiFi シーケンスによるDNAメチル化測定
同じライブラリーから、ゲノムワイドに遺伝的およびエピジェネティックなバリアントを検出し、ハプロタイプフェージングを行います。同一サンプルのHiFiシーケンスにより、転写開始点でのハイパーメチル化を含む、ゲノム全体のメチル化パターンを検出します。複数サンプルのシーケンスにより、メチル化の違いを特定します。
OnsoシステムSBB（Sequencing by Binding）
革新的なSBBテクノロジーを搭載したOnsoシステムは、これまでにない精度と感度を実現し、お客様の研究を前進させます。
HIFIの違い - 大規模で高品質なデータを、ALL OF US へ
HiFiリードは、小さなバリアントと大きなバリアントの両方で最も正確な結果を出しました。”そして、ロングリードは、All of Usや潜在的に他の多くのプロジェクトで最も完全で正確なバリアントコールを確立するために広く評価されています。”と彼は言います。
高精度ロングリードによるシングルセル解析のパラダイムシフト
細胞集団の異質性をアイソフォームレベルで理解することは、基礎研究や疾患研究にとって重要です。HiFiリードは、遺伝子発現のみを解析するショートリードに比べて、シングルセル研究においてもアイソフォームやフージョンなどを正確に検出することができます。
プレスリリース
これらのプレスリリースは翻訳されています。全てのリリースは ALL press releases (in English) をご覧ください
- Application brochure – HiFi reads for highly accurate long-read sequencing (日本語）
- Human genomics overview brochure (日本語）
- Application Brief – Variant detection using whole genome sequencing with HiFi reads best practices (日本語）
- Application note – MAS-seq (日本語）
- Application brief – Measuring DNA methylation with 5-base HiFi sequencing (日本語）
- Sequencing 101: Long-read sequencing
サポートコンテンツ
私たちの最優先事項の一つは、現在そして未来のお客様の新たな科学的発見ために必要なツールを提供することです。PacBioでは、あらゆるレベルの研究活動を支援するための幅広いリソースをお客様をサポートするために提供しています。
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