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PacBio Japan

Say goodbye to yesterday’s RNA-Seq — say hello to
Kinnex

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PacBioシーケンシングシステム

長年にわたる最先端の研究開発に基づき、当社のシステムは、研究者の皆様による世界を変えるような新発見のお手伝いを可能にします。 当社のロングリードおよびショートリードシーケンスシステムの比類ない精度をご覧ください。

Smaller 400x400 image of Revio system front - PacBio

Revioカタログ   Revio 仕様書

REVIOシステム ロングリードシーケンス

業界最高精度のHiFiシーケンスにより、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームの包括的視点を提供

年間最大1,300のヒトHiFiゲノムを処理するスループット

消耗品は取り扱いが簡単でプラスチック廃棄物を削減

Google Health DeepConsensusを搭載した強力な計算機能

Illustration of the Onso system sequencer turned to the right - PacBio

Onsoカタログ   Onso 仕様書

Onsoシステム

ショートリードシーケンス

他のベンチトップシーケンサーと比較して最大15倍の高精度

SBSシーケンサーと比較して、要求されるカバレッジデプスを削減

ホモポリマーなどシーケンス困難な領域を解決

重複率が低く、インデックスホッピングはごくわずか

既存のP5/P7ライブラリーをOnsoシステム上でシーケンス可能にするコンバージョンキット

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Sequel IIカタログ

Sequel IIeシステムロングリードシーケンス

すべてのランにおいて、装置から直接DNAメチル化検出を伴う長く正確なHiFiリードを取得

ターゲットシーケンス、RNAシーケンス、全ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションをサポート

微生物ゲノムシーケンス、AAVベクターシーケンス、Iso-Seqなどのスループットに適合

何百もの査読付き出版物で紹介された実証済みの技術

Japan Blog

このブログでは、HiFiシーケンスと翻訳に関する最新の研究、出版、アップデートについて、パートナーや同僚からの投稿を紹介します。

アプリケーション

ターゲットまたは全ゲノムシーケンス、複雑な集団の研究、アイソフォームやエピジェネティック修飾の発見など、PacBioシーケンスはお客様の研究を向上させ、競争優位をもたらします。

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全ゲノムシーケンス

全ゲノムシーケンス(WGS)は、ヒト、植物、動物、微生物を問わず、生物のDNA全体を評価します。HiFiシーケンスは、反復配列領域や高GCの多い領域においても、最大25kbの1分子リードから偏りのない99.9%のリード精度(Q30)で完全かつ正確な分解能で全ゲノムシーケンス情報を取得します。

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ターゲットシーケンス

ターゲットシーケンスでは、ゲノム中の最も到達しにくい領域であっても、様々なバリアントタイプを正確に検出し、その理解を深めることができます。当社のターゲットシーケンスアプリケーションは、HLAシーケンスを含む、ヒトの生物医学研究、植物および動物科学、微生物学および感染症におけるアプリケーションに適しています。

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RNA シーケンス

長くて正確なHiFiリードを用いたIso-Seq法による全長転写産物シーケンスでは、転写開始点と終了点の確認、スプライシングイベントの解析、アレル特異的アイソフォームの特定、アイソフォームレベルの分解能での発現プロファイル、融合遺伝子の検出、オープンリーディングフレームの全長予測など他のシーケンサーでは見過ごされる可能性のある新しい生物学的特性を見出すことが可能となります。

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エピジェネティクス

HiFi シーケンスのユニークなケミストリーは、サンプルのエピジェネティック変化を直接的に捉えることを可能にします。メチル化検出を含む“5塩基HiFiシーケンス”により、研究者は同じシーケンスライブラリから遺伝子活性やその他の生物学的機能に関連するゲノム全体のメチル化パターンを特定することができます。

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メタゲノムシーケンス

微生物群集がどのように機能し、また、環境と相互作用しているかについての新たな知見を得るためには、より優れたアプローチを必要とします。長くて正確なHiFiリードは、種レベルの分解能をもつ完全長16Sシーケンス、個々の遺伝子の機能解析を含むメタゲノムプロファイリングやそのアセンブリを可能とします。

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シーケンス技術

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HiFiリードとは何か?

HiFi リードは、PacBio ロングリードシステムのcircular consensus sequencing (CCS) mode を用いて作成されます。HiFiリードは、1分子リード精度 99.9%の塩基レベルの解像度を提供します。

HiFiリードは、de novoアセンブリのための全ゲノムシーケンス、包括的なバリアント検出、エピジェネティックな特性評価、RNAシーケンスなど、幅広いSMRTシーケンスアプリケーションで使用することができます。

How HiFi works - Japanese version

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Long-read sequencing

HiFi Sequencing

HiFi シーケンスは、高精度かつ完全なシーケンス技術として認知されています。

  • PacBio HiFiはPrecisionFDAベンチマークにおけるトータルエラー(SNV + indel + SV)で異なるロングリードシーケンス技術だけでなく、既存のSBS技術に比べても大きくエラーを削減可能
  • 最大25kbのリード長により、大きな構造変異や困難な反復領域をカバーし、全長転写産物をシーケンス可能
  • 99.99%の精度を誇る高精度なシーケンス結果
    均一なカバレッジにより、他のテクノロジーではアクセスできない領域のシーケンスが可能
  • シーケンス中にメチル化など塩基修飾を直接検出することで、エピジェネティクス研究を加速

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More precise genomes for precision medicine

解析ツール

PacBio社では、HiFiシーケンスのデータからより多くの発見をお手伝いするために新しいツールで常に革新を続けています。

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HIFIの違い - 大規模で高品質なデータを、ALL OF US へ

HiFiリードは、小さなバリアントと大きなバリアントの両方で最も正確な結果を出しました。”そして、ロングリードは、All of Usや潜在的に他の多くのプロジェクトで最も完全で正確なバリアントコールを確立するために広く評価されています。”と彼は言います。

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Piecing together the puzzle of genetic disease

ウェビナー

ゲノミクスの様々なトピック、業界のリーダーやテクノロジーに関するオンデマンドのウェビナーを見ることができます。

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リソース

10,000以上の記事、レポート、論文、動画を収録した総合的なライブラリーがあることをご存知ですか?

リソースを探す(英語)

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スポットライト:全長RNAシーケンス

KINNEX FULL-LENGTH RNA KITは、スケーラブルでコスト効率の高いアイソフォームシーケンスを可能にします。

Kinnex full-length RNA kitは、最大10 kbまでの完全長アイソフォームを生成します。Iso-Seq express 2.0 kitおよびSMRT Linkでの解析と組み合わせることで、お客様のRNA研究において既知および新規アイソフォームの特性解析および発現比較を可能にします。

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サポートコンテンツ

私たちの最優先事項の一つは、現在そして未来のお客様の新たな科学的発見ために必要なツールを提供することです。PacBioでは、あらゆるレベルの研究活動を支援するための幅広いリソースをお客様をサポートするために提供しています。

技術サポート

カスタマーポータルからテクニカルサポートにお問い合わせください。

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トレーニング

ウェビナー、e-モジュール、ユーザーガイドなど、充実したトレーニング教材を提供しています。

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ドキュメンテーション

当社の豊富な資料データベースにより、SMRT技術の概要と研究環境での使用方法を詳細に把握することができます。

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ソフトウェアダウンロード

オープンソースソフトウェアのコレクションは、お客様の研究努力を高め、シーケンスの能力を向上させるために設計されています。

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