PacBio, Revio 시퀀싱 시스템을 위한 새로운 SPRQ Chemistry 출시
New long-read sequencing chemistry: HiFi 인간 유전체 시퀀싱 비용 샘플당 500달러 이하로 절감, DNA 주입량 4배 감소, 하나의 SMRT cell에서의 데이터 출력 33% 증가, methylation calling 향상 및 멀티오믹스 지원 확대
캘리포니아 멘로파크 – 2024년 10월 29일 – PacBio (나스닥: PACB), 고품질 고정밀 시퀀싱 솔루션을 선도하는 개발사인 PacBio가 자사의 Revio™ long-read sequencing시스템을 위한 향상된 화학기술인 SPRQ의 출시를 발표했다. 이 새로운 기술은 Revio의 DNA 주입량을 기존대비4배로 줄인, 샘플당 500ng의 DNA량만 필요하게 해주며, 이를 통해서 타액이나 PacBio의 새로운 Nanobind 프로토콜로 추출된 종양 샘플과 같은 다양한 샘플을 HiFi sequencing기술로 처리할 수 있게 해준다. 또한 개선된 분석 방법과 결합하여 Revio 시스템의 데이터 출력량을 증가시킬 수 있으며, 이는 유전체 시퀀싱 비용을 최대 50%까지 절감할 수 있도록 해준다.
더불어, 새로운 소프트웨어 업데이트를 통해 methylation분석의 정확도가 향상되고, 새로운 유형의 methylation 마커도 탐지가 가능해짐으로서, 다양하고 풍부한 멀티오믹스 분석이 가능해졌다.
“지난 2년간, 많은 연구자들이 게놈프로젝트, 인간과 각종 동식물 및 미생물의 유전자를 시퀀싱하는데 HiFi기술이 우수하다는 것을 알게되면서 Revio시스템에 대한 수요가 급증했습니다”라고 PacBio의 최고 경영자(CEO)인 크리스찬 헨리(Christian Henry)는 말했다.
“우리는 HiFi 인간 유전체 시퀀싱 성능을 크게 개선하여, 시퀀싱 비용을 샘플당 500달러 이하로 낮추는 획기적인 성과를 이뤄냈습니다. SPRQ 화학 기술은 Revio 시스템을 이용하여 더 많은 샘플을 시퀀싱할 수 있는 가능성을 열어줍니다. 이 기술은 기존의 모든 Revio 시스템에 호환되며, 간단한 소프트웨어 업데이트만으로 적용할 수 있습니다. 이번 출시로 PacBio는 고객 저변을 확대하여 과학적 발견의 새로운 전환점을 맞이하게 되었습니다.”
SPRQ chemistry기술은 DNA 주입량을 기존보다 4배 줄인 500ng만을 필요하게 함으로서, Revio SMRT cell loading 효율을 높인다. 또한 시퀀싱 성능을 향상시켜 SMRT cell하나당 시퀀싱 생산성을 33% 향상시킨다. 이로서 Revio 시스템 한대로 연간 최대 2,500개의 인간 전장 유전체 (human whole genome)를 시퀀싱 할 수 있으며, 시퀀싱 비용은 샘플당 500달러 이하가 될 것이다.
“DNA 주입량 감소와 시퀀싱 생산성 증가는 우리 사용자들에게 큰 성과입니다”라고 Broad Clinical Labs의 회장 겸 과학 부문 최고 책임자인 Niall Lennon은 말했다. “기존 기술로는 long reads를 생성하기 어려운 샘플들이 많이 있었는데, 새로운 SPRQ 기술을 사용하여 이들 중 80%의 샘플에서 long reads를 생성할 수 있었습니다. Long read data를 생성하는 성공율이 높아지고 비용은 낮아지는 덕분에, 다양한 응용분야에 더 넓게 접근할 수 있게 되었고, 새로운 것을 발견하는 속도도 빨라졌습니다.”
또한 SPRQ와 함께 제공되는 SMRT Link 및 소프트웨어 업그레이드를 통해 새로운 DNA methylation 분석 도구를 제공할 것이며, 이는 Revio의 멀티오믹스 기능을 대폭 강화 시킬 것이다. 이 소프트웨어는 5mC methylation 분석 정확도를 향상시켜, HiFi 시퀀싱이methylation array의 대안이 될 수 있도록 해준다. 또한 Fiber-seq분석에서 open chromatin의 마커로 사용되는 6mA methylation 분석기능도 추가된다. 이를 통해 한번의 DNA 주입과 시퀀싱만으로 DNA, methylation, chromatin accessibility에 대한 모든 정보를 얻을 수 있게 된다.
“우리 연구실의 Fiber-seq 분석은 HiFi 시퀀싱을 통해 제공되는 유전체의 멀티오믹 뷰에 chromatin accessibility를 포함합니다. Fiber-seq은 pangenome연구, 희귀 질환 연구, 체세포 변이 연구에 점점 더 많이 사용되고 있습니다. Revio 시스템은 보다 정확한 6mA methylation 분석을 가능하게 해주며, 이는 Fiber-seq 염색질 패턴 분석을 위한 계산 과정을 단순화 시켜줍니다. 그럼으로써, 더 많은 연구 연구자들이 Fiber-seq을 채택할 것으로 기대합니다” -Andrew Stergachis, MD, PhD, 워싱턴대학교 의과대학 유전학 부교수-
PacBio는 2024년 11월 5일부터 9일까지 콜로라도 덴버에서 열리는 미국 인간유전학회(ASHG) 연례 회의에서 새로운 SPRQ 를 이용한 데이터를 워크숍에서 발표할 예정이다. “희귀 질환 연구의 새로운 시대: 임상 및 인구 유전체학 연구에서의 HiFi 시퀀싱 활용 ” 이라는 주제로 열리는 워크숍은 2024년 11월 8일 오후 12시부터 1시까지(현지 시간) 109-111-113호 강의실에서 진행된다. 이번 워크숍에는 PacBio 글로벌 마케팅 부사장 David Miller, PacBio Computational Biology 부사장 Michael Eberle 박사, Children’s Mercy Kansas City 유전학 부서장 Carol Saunders(FACMG), 에스토니아 생명공학 연구소 유전체학 연구소장 Mait Metspalu 박사가 연사로 나선다. 또한 PacBio는 ASHG 주간 동안 725번 부스에서 전시를 진행한다.
SPRQ chemistry와 SMRT Link소프트웨어는 지금 바로 주문이 가능하며, 2024년 12월부터 순차적으로 배송이 시작된다. 자세한 내용은 자사 홈페이지를 통해 확인이 가능하다. https://programs.pacb.com/ashg2024.
PacBio 소개
PacBio(나스닥: PACB)는 유전적으로 복잡한 문제를 해결하는 데 도움을 주기 위해 첨단 시퀀싱 솔루션을 설계, 개발, 제조하는 선도적인 생명과학 기술을 보유한 기업입니다. PacBio의 제품과 기술은 정확성, 품질 및 완성도를 강조하는 HiFi long read sequencing과 SBB® short read sequencing이라는 두 가지 차별화된 핵심 기술에서 비롯되었습니다. PacBio의 솔루션은 인간 생식 세포 시퀀싱, 식물 및 동물, 전염병 및 미생물학, 종양학 등 다양한 연구 분야 및 기타 새로운 응용 분야에 걸쳐 사용되고 있습니다. 자세한 정보는 www.pacb.com에서 확인하시고 @PacBio를 팔로우하세요.
PacBio 제품은 연구용으로만 제공되며, 진단을 목적으로 사용할 수 없습니다.
미래 예측 진술
이 보도자료에는 1934년 증권거래법 제21E조 및 1995년 미국 사적 증권 소송 개혁법에 따른 “미래 예측 진술”이 포함될 수 있습니다. 과거의 사실 진술을 제외한 모든 진술은 미래 예측 진술에 해당하며, 여기에는 PacBio 제품이나 기술 사용의 용도, 적용 범위, 장점, 품질, 성능 또는 기대되는 효과에 관한 진술이 포함됩니다. 예를 들어, DNA 주입량 감소, 샘플당 500달러 이하의 HiFi 유전체 분석 비용 절감, 데이터 출력 증가, methylation량 분석 정확도, chromatin accessibility, 분석 가능한 샘플 유형, 연간 시퀀싱 유전체 수, 멀티오믹스 통찰 등과 관련된 진술이 이에 해당합니다. 이러한 진술에 지나친 신뢰를 두지 말아야 하며, 실제 결과는 다양한 가정, 위험 및 불확실성으로 인해 예측과 크게 다를 수 있습니다. 이러한 위험 요소에는 다수의 유전체 시퀀싱의 도전 과제, 연구 분야별 발견 생성의 어려움, 제품 성능 및 품질 문제, 특허 및 소유권 침해 주장, PacBio의 특허 무효화 시도, 국제 운영에 따른 기타 위험 등이 포함됩니다. 실제 결과에 중대한 영향을 미칠 수 있는 추가 요인은 증권거래위원회에 제출한 PacBio의 최신 보고서(8-K, 10-K, 10-Q 양식 포함)의 “위험 요소” 항목에서 확인할 수 있습니다. 이러한 미래 예측 진술은 현재의 기대에 기반하고 있으며, 법률상 요구되지 않는 한, PacBio는 향후 사건이나 상황을 반영하기 위해 본 미래 예측 진술을 수정 또는 업데이트할 의무를 지지 않습니다.
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