PacBio 宣布为 Revio 测序系统推出 SPRQ 化学技术,这一重大进展可将 HiFi 人类基因组的成本降至 500 美元以下
新的长读长测序化学将 DNA起始量减少了四倍,使每个 SMRT cell的数据产出增加了 33%,提高了甲基化检测率,并扩展了对多组学的支持
加州门洛帕克 – 2024 年 10 月 29 日 – 领先的高质量、高精度测序解决方案开发商 PacBio (NASDAQ: PACB) 今天宣布推出 SPRQ,这是其 Revio™ 长读测序系统的改进测序化学方法。新化学方法将 Revio DNA起始量要求降低 4 倍,低至每个样本 500ng,从而可以使用 HiFi 测序技术对更多样本类型(例如使用 PacBio 的新 Nanobind 核酸提取流程提取的唾液和肿瘤样本)进行测序。它还将增加 Revio 系统的产出,再加上改进的分析方法,使客户能够将每个基因组的测序成本降低高达 50%。配对仪器软件增强功能还将提高甲基化检出的准确性,并增加对新类型甲基化标记的检测,为客户提供每个样本的丰富多组学视图。
“过去两年来,我们看到了对 Revio 系统的巨大需求,因为越来越多的研究人员发现了 HiFi 技术在群体测序以及其他人类和非人类测序应用方面的优势。” PacBio 总裁兼首席执行官 Christian Henry 说道。“我们的团队取得了重大突破,显著提高了性能,并将 HiFi 人类基因组的成本降低到每样本 500 美元以下。SPRQ 化学技术为使用 Revio 系统对更多样本进行测序提供了可能性。只需进行非常简单的软件更新,这种化学技术即可与在用Revio仪器兼容。它的推出是 PacBio 的一个真正转折点——为客户采用和科学发现开辟了新的轨迹。”
SPRQ 化学技术将提高 Revio SMRT cell的加载效率,将 DNA 输入要求降低至仅 500 ng,减少了四倍。该化学技术还将提高测序性能,使每个 SMRT cell的测序产量提高 33%。总的来说,这些增强功能将使每台 Revio 仪器每年能够完成多达 2,500 个人类全基因组测序,而每个人类基因组的成本低于 500 美元。
Broad Clinical Labs主席兼首席科学官Niall Lennon表示:“产量的提高和输入要求的降低对我们的用户群体来说是一个巨大的胜利。在我们有许多以前无法生成长读长的样本的研究中,我们能够使用SPRQ化学方法挽救80%的样本。长读长数据生成的成功率更高、成本更低,这增加了使用更广泛科学应用的机会,并加快了科研探索的步伐。”
此外,SMRT Link 和仪器软件升级与 SPRQ 化学技术的发布相结合,提供了新的 DNA 甲基化检出工具,大大提高了每次 Revio 运行的多组学应用能力。该软件提高了5mC 的检出准确性,使 HiFi 测序成为替代甲基化芯片的一个有吸引力的方案。它还增 加 了检出6mA 的新功能,6mA 被用作 Fiber-seq 检测中开放染色质的标记,只需通过一次 DNA 测序反应,即可提供 DNA 变异、甲基化和染色质的可及性信息。
“我们实验室的 Fiber-seq 检测为 HiFi 测序提供的基因组多组学视图增加了染色质可及性数据。Fiber-seq 在泛基因组研究、罕见疾病研究和体细胞变异研究中的应用越来越广泛。我们很高兴看到 Revio 系统上有一个准确的 6mA 检测功能,可以简化 Fiber-seq 染色质模板的计算分析以期业界同行的高度采纳,”华盛顿大学医学遗传学副教授 Andrew Stergachis 医学博士、哲学博士说。
PacBio 将于 2024 年 11 月 5 日至 9 日在科罗拉多州丹佛举行的美国人类遗传学学会年会研讨会上展示有关新 SPRQ 化学的数据。研讨会将于 2024 年 11 月 8 日中午 12:00-下午 1:00 在 109-111-113 室举行,主题为“罕见病研究的新时代:将 HiFi 测序整合到临床实践和群体基因组学中”,演讲者包括 PacBio 全球营销副总裁 David Miller、PacBio 计算生物学副总裁 Michael Eberle 博士、堪萨斯城儿童仁慈医院临床和实验室遗传学与基因组学部门主任 Carol Saunders 博士、FACMG 和爱沙尼亚生物中心基因组学研究所所长 Mait Metspalu 博士。PacBio还将在展位 #725 进行整周的展览。
SPRQ 化学和 SMRT Link 软件可立即开始订购,并将于 2024 年 12 月开始发货。如需了解更多信息,请访问 https://programs.pacb.com/ashg2024.。
关于 PacBio
PacBio (纳斯达克股票代码:PACB) 是一家领先的生命科学技术公司,致力于设计、开发和制造先进的测序解决方案,帮助科学家和临床研究人员解决复杂的遗传问题。我们的产品和技术源自两项高度差异化的核心技术,专注于准确性、质量和完整性,包括我们的 HiFi 长读测序和我们的 SBB® 短读测序技术。我们的产品为广泛的研究应用提供解决方案,包括人类生殖系测序、植物和动物科学、传染病和微生物学、肿瘤学和其他新兴应用。欲了解更多信息,请访问 www.pacb.com 并关注 @PacBio。
PacBio 产品仅供研究使用。不可用于诊断。
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