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Quality Statement

Pacific Biosciences is committed to providing high-quality products that meet customer expectations and comply with regulations. We will achieve these goals by adhering to and maintaining an effective quality-management system designed to ensure product quality, performance, and safety.

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Image Use Agreement

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Pacific Biosciences
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ロングリードシーケンスでデータから発見へ

PacBioの1分子リアルタイム(SMRT)シーケンスの可能性は、シークエンスデータの解析、視覚化、アノテーション用の解析ツールポートフォーリオを使うことで、最大限化することができます。この解析ポートフォーリオは複数のアプリケーションに使用でき、またSMRT Analysisソフトウェアが組み込まれているSMRT Link、コミュニティによる解析ツール開発を促すPacBio DevNet、そして信頼のあるパートナー会社によるSMRT互換性ソフトウェアソリューションを含みます。

SMRT Analysisソフトウェア

SMRT Linkに組み込まれているSMRT Analysisは、SMRTシークエンスデータを解析するすべての研究者に比類ない計算力をもたらします。

SMRT Analysisは、使用が簡単なグラフィカルユーザーインターフェース、柔軟性の高いコマンドラインオプション、そして下流解析ワークフローとの統合を可能にする拡張APIセットを提供します。

SMRT Analysisの詳細はこちらから

SMRT Analysisへのアクセスを可能にするSMRT Linkをダウンロード

 

PacBio DevNet

PacBioではバイオインフォマティクス専門家と一緒に、SMRTシークエンスデータの解析およびアノテーションのオープンソースソフトウェアの開発に取り組んでいます。

DevNetはコミュニティが開発したPacBioデータ用のオープンソース解析ツール、SMRTシークエンスデータセット、そしてデータ解析および解釈の手助けとなるリソースを集約したサイトです。

PacBio DevNetの詳細はこちらから

PacBio DevNetにアクセス

 

SMRT Compatible Analysis Products

信頼のある解析パートナーと共に、PacBioデータとシークエンスプロジェクトのゴールの可能性を拡張します。

計算機資源から三次解析まで、これらのパートナーは幅広いソリューションとサービスを提供し、SMRT Analysis製品をさらに補完します。

SMRT Compatible Analysis Productsの詳細はこちらから

 

アプリケーションと手法ごとの解析ツール

PacBioの解析ポートフォーリオは複数のアプリケーションに応用できます。これらのアプリケーションと解析ツールについては、下記の表をご参照ください。

 

アプリケーション解析ツール
全ゲノムシークエンス
ヒト、動植物、微生物に置けるde novo シークエンス及び構造変異検出
全ゲノムシークエンス解析ツールde novoアセンブリおよび構造変異検出
RNAシークエンス
全トランスクリプトーム及びターゲット遺伝子におけるcDNAシークエンスの深い洞察
RNAシークエンス解析ツールとIso-Seq手法により、アイソフォームの検出と特徴付け
ターゲットシークエンス
興味のあるゲノム領域にフォーカスして研究
ターゲットシークエンス解析ツールにより構造変異、稀なSNPやIndelの検出、ハプロタイピングおよびフェーズ化
複雑な集団
微生物、ウィルス、がん細胞集団などにおける変異を理解
複雑な集団解析ツールによりde novoアセンブリ、CCS、マイナー変異および塩基修飾を解析
エピジェネティクス
シークエンスとDNA修飾をPacBioプラットフォームで同時に検出
エピジェネティクス解析ツールでは塩基取り込みの速度を測定することで塩基修飾を直接検出しモチーフを解析

 

特集:手法

マルチプレックス – 1枚のSMRT Cell上で複数のサンプルをロングリードシークエンスすることで、研究にさらなるサンプルスループットと効率化をもたらします。

マルチプレックスの詳細はこちらから

SMRTシークエンスがどのように研究をサポートできるか、お問い合わせください